МикроРНК в тканях и биологических жидкостях рассматриваются как диагностические биомаркеры и терапевтические мишени многих, в том числе онкологических заболеваний. Особую ценность имеют биомаркеры, присутствующие в легкодоступных биологических жидкостях, в первую очередь, в крови. Потенциал микроРНК как предиктивных онкомаркеров и терапевтических мишеней изучают с использованием глобального профилирования, которое обеспечивается секвенированием нового поколения (NGS). NGS обладает высокой чувствительностью, однонуклеотидным разрешением и позволяет одновременно профилировать большое число образцов. Несмотря на многообещающий потенциал микроРНК как биомаркеров и рост числа работ в этом направлении, недостаточно освещенными остаются проблемы, связанные с методами подготовки образцов, спецификой получения библиотек для секвенирования, сложностями количественного анализа. Подготовка библиотек микроРНК для секвенирования имеет определенные трудности и требует подбора условий для каждого типа биологического материала. В настоящей работе подробно описано приготовление библиотек микроРНК из опухолевой ткани аденомы гипофиза и плазмы крови пациентов с акромегалией для секвенирования на платформе Illumina. Рассмотрены сложности и ограничения методов, а также оценена эффективность секвенирования образцов плазмы и мозга. Работа может служить руководством для исследователей, изучающих механизмы регуляции микроРНК при эндокринных заболеваниях гипофиза, а также позволит адаптировать технические процедуры к разным биологическим образцам и разным патологиям.
Индексирование
Scopus
Crossref
Higher Attestation Commission
At the Ministry of Education and Science of the Russian Federation