By this author

INFLUENCE OF VARIOUS FACTORS ON THE TRANSCRIPTION ACTIVITY OF POGO TRANSPOSONS IN THE PACIFIC OYSTER CRASSOSTREA GIGAS

Issue number 4 from 31.01.2026

Одной из наиболее распространенных групп ДНК-транспозонов является надсемейство pogo. В геноме тихоокеанской устрицы Crassostrea (Magallana) gigas (Thunberg, 1793) описано 10 pogo-транспозонов. В нашей работе показано, что элементы pogo устрицы относятся преимущественно к трем семействам: pogoR, Passer и Foi. Анализ геномов пяти особей устрицы выявил девять элементов pogo у всех особей, один элемент (Mariner-38 CGi) обнаружен только в двух геномных сборках. Исследованные геномные сборки различались как по числу копий pogo-транспозонов, так и по их протяженности, а также по наличию и длине инвертированных повторов. Данные по эволюционной динамике pogo-транспозонов и небольшое число их копий в геномах отдельных особей свидетельствуют о низкой активности на протяжении жизненного цикла. Анализ транскрипционной активности показал, что для элементов Mariner-30 CGi и Mariner-34 CGi более чем в половине случаев характерна постоянная или зависимая от условий экспрессия. Транскрипционная активность пяти элементов зависела от стадии развития. Предполагается, что эти элементы могли быть одомашнены (кооптированы) геномом устрицы. Это исследование расширяет наши представления об эволюции pogo-транспозонов и их роли в диверсификации геномов животных.

64 0