By this author

CG10543 Protein is Involved in the Regulation of Transcription of Ecdysone-Dependent Genes

Issue number 4 from 19.03.2026

Несмотря на растущее количество данных о свойствах ориджинов репликации, молекулярные механизмы, лежащие в основе позиционирования комплекса ORC в геноме, ясны не до конца. Высказано предположение, что ключевыми факторами, определяющими позиционирование ORC в геноме, являются ДНК-связывающие белки, которые формируют различные регуляторные элементы ДНК, включая инсуляторы, промоторы и энханессры, что обеспечивает связь программы репликации с различными уровнями регуляции транскрипции. Первым примером таких белков стал обнаруженный нами ранее белок Su(Hw). В ходе дальнейших работ был идентифицирован еще ряд ДНК-связывающих белков, включая CG10543, которые могут отвечать за формирование соответствующих регуляторных элементов и привлечения транскрипционных и репликационных комплексов на свои сайты связывания. Показано, что белок CG10543 дрозофилы взаимодействует с деубиквитинирующим (DUB) модулем комплекса SAGA. Сайты связывания белка CG10543 расположены преимущественно в промоторных областях активных генов и колокализуются с комплексами модификации и ремоделирования хроматина SAGA и dSWI/SNF, а также с репликационным комплексом ORC. С целью изучения роли белка CG10543 в регуляции транскрипции провели RNA-Seq-эксперимент в клетках S2 дрозофилы как в норме, так и при РНК-интерференции CG10543. Показали, что белок CG10543 влияет на транскрипцию 469 генов, причем существенная часть этих генов (23%) относится к экдизон-зависимым. Экдизон – это основной стероидный гормон дрозофилы, ответственный за метаморфоз и оказывающий существенное влияние на экспрессию множества генов в процессе развития дрозофилы. Нами показано, что сайты CG10543 колокализуются с белком СВР и гистоновой меткой H3K27Ac, что характерно для активных регуляторных элементов. Белок CG10543 также колокализуется с белком CP190, что может свидетельствовать о регуляции транскрипции посредством дальних взаимодействий между регуляторными элементами.

84 0

Mle (DHX9) helicase regulates the expression of constitutive and inducible isoforms of the conserved nuclear receptor FTZ-F1 (NR5A3)

Issue number 2 from 19.03.2026

Хеликаза MLE Drosophila melanogaster участвует не только в дозовой компенсации, но и выполняет множество функций в регуляции экспрессии генов, как и ее ортолог DHX9 человека. Многие функции MLE консервативны в эволюции и при этом не изучены. MLE, как показано ранее, участвует в регуляции индуцибельной транскрипции гена ftz-f1, кодирующего эволюционно-консервативный ядерный рецептор NR5A3. Ген ftz-f1 кодирует также и конститутивный транскрипт, синтез которого начинается с альтернативного промотора. В настоящей работе изучали роль MLE в регуляции конститутивной транскрипции гена ftz-f1. Показано, что в культуре клеток S2 MLE связывается с конститутивным промотором и контролирует как индуцибельную, так и конститутивную транскрипцию этого гена. Обнаружен новый цис-регуляторный элемент гена ftz-f1 – энхансер 663, с которым связывается MLE. Методом фиксации конформации хромосом показано, что в культуре клеток S2 энхансер 663 взаимодействует с конститутивным и индуцибельным промоторами гена ftz-f1. Изучение активности энхансера 663 по уровню ацетилирования гистона Н3 показало, что он вовлечен в работу обоих промоторов. Нокдаун MLE в культуре клеток S2 вызывает усиление конститутивной транскрипции. Впервые показано влияние in vivo MLE D. melanogaster на транскрипцию вне дозовой компенсации на стадии имаго. Показано, что на стадии имаго MLE связывается с обоими промоторами и с энхансером 663. Мутация в гене mle приводит к усилению экспрессии обоих транскриптов гена ftz-f1 у самок. Полученные данные важны для понимания и дальнейшего изучения эволюционно-консервативных механизмов работы хеликазы MLE D. melanogaster и ее ортолога DHX9 у человека.

11 0