ОБНМолекулярная биология Molecular Biology

  • ISSN (Print) 0026-8984
  • ISSN (Online) 3034-5553

СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ ПУРИН-НУКЛЕОЗИДФОСФОРИЛАЗЫ E. COLI В РЕАКЦИЯХ ФОСФОРОЛИЗА ПУРИНОВЫХ РИБОНУКЛЕОЗИДОВ, СОДЕРЖАЩИХ ЦИКЛИЧЕСКИЙ ТЕРПЕНОВЫЙ ФРАГМЕНТ

Код статьи
S30345553S0026898425050089-1
DOI
10.7868/S3034555325050089
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 59 / Номер выпуска 5
Страницы
835-844
Аннотация
Пурин-нуклеозидфосфорилаза Escherichia coli (ПНФ E. coli) является модельным ферментом для изучения метаболизма и устойчивости биологически активных нуклеозидов в клетке. В представленной работе изучали субстратную специфичность ПНФ E. coli в реакциях фосфоролитического расщепления гликозидной связи в производных аденозина, содержащих циклический терпеновый фрагмент, как предшественников биологически активных производных пурина. Получен ряд N-терпензамещенных производных аденозина с различной структурой углеводородного заместителя. Путем измерения кинетических параметров реакции фосфоролиза показано, что производные аденозина, содержащие бициклический углеводородный фрагмент, эффективнее связываются с ферментом, чем их моноциклические производные. Полученные результаты позволяют в мягких условиях получать новые производные пурина, содержащие липофильный терпеновый остаток.
Ключевые слова
биосинтез нуклеозидов кинетика фосфоролиз пурин-нуклеозидфосфорилаза терпены субстратная специфичность
Дата публикации
31.01.2026
Год выхода
2026
Всего подписок
0
Всего просмотров
54

Библиография

  1. 1. Wagner K.-H., Elmadfa I. (2003) Biological relevance of terpenoids. Ann. Nutr. Metab. 47, 95–106.
  2. 2. Ощепков М.С., Калистратова А.В., Савельева Е.М., Романов Г.А., Быстрова Н.А., Кочетков К.А. (2020) Природные и синтетические цитокинины и их применение в биотехнологии, агрохимии и медицине. Успехи химии. 89, 787–810.
  3. 3. Sakakibara H. (2010) Plant Hormones: Biosynthesis, signal transduction, action. Springer: Dordrecht, 95–114.
  4. 4. Voller J., Zatloukal M., Lenobel R., Doležal K., Béreš T., Kryštof V., Spíchal L., Niemann P., Džubák P., Hajdúch M., Strnad M. (2010) Anticancer activity of natural cytokinins: a structure–activity relationship study. Phytochemistry. 71(11–12), 1350–1359.
  5. 5. Kamada-Nobusada T., Sakakibara H. (2009) Molecular basis for cytokinin biosynthesis. Phytochemistry. 70(4), 444–449.
  6. 6. Романов Г.А. (2009) Как цитокинины действуют на клетку. Физиология растений. 56(2), 295–319.
  7. 7. Drenichev M.S., Oslovsky V.E., Mikhailov S.N. (2016) Cytokinin nucleosides-natural compounds with a unique spectrum of biological activities. Curr. Top. Med. Chem. 16(23), 2562–2576.
  8. 8. Efimtseva E.V., Kulikova I.V., Mikhailov S.N. (2007) Disaccharide nucleosides and their incorporation into oligonucleotides. Curr. Org. Chem. 11, 337–354.
  9. 9. Rozenski J., Crain P.F., McCloskey J.A. (1999) The RNA modification database: 1999 update. Nucl. Acids Res. 27(1), 196–197.
  10. 10. Tararov V.I., Tijsma A., Kolyachkina S.V., Oslovsky V.E., Neyts J., Drenichev M.S., Leyssen P., Mikhailov S.N. (2015) Chemical modification of the plant isoprenoid cytokinin N6-isopentenyladenosine yields a selective inhibitor of human enterovirus 71 replication. Eur. J. Med. Chem. 90, 406–413.
  11. 11. Young D.C., Layre E., Pan S.J., Tapley A., Adamson J., Seshadri C., Wu Z., Buter J., Minnaard A.J., Coscolla M., Gagneux S., Copin R., Ernst J.D., Bishai W.R., Snider B.B., Moody D.B. (2015) In vivo biosynthesis of terpene nucleosides provides unique chemical markers of Mycobacterium tuberculosis infection. Chem. Biol. 22(4), 516–526.
  12. 12. Oldfield E. (2015) Tuberculosis terpene targets. Chem. Biol. 22(4), 437–438.
  13. 13. Buter J., Cheng T.Y., Ghanem M., Grootemaat A.E., Raman S., Feng X., Plantijn A.R., Ennis T., Wang J., Cotton R.N., Layre E., Ramnarine A.K., Mayfield J.A., Young D.C., Jezek Martinot A., Siddiqi N., Wakabayashi S., Botella H., Calderon R., Murray M., Ehrt S., Snider B.B., Reed M.B., Oldfield E., Tan S., Rubin E.J., Behr M.A., van der Wel N.N., Minnaard A.J., Moody D.B. (2019) Mycobacterium tuberculosis releases an antacid that remodels phagosomes. Nat. Chem. Biol. 15(9), 889–899.
  14. 14. Mathews C.K., Van Holde K.E. (1996) Biochemistry. San Francisco: Benjamin Cummings PC.
  15. 15. Jensen K.F., Dandanell G., Hove-Jensen B., WillemoËs M. (2008) Nucleotides, nucleosides, and nucleobases. EcoSal Plus. 3(1), 1‒39.
  16. 16. Brown A.M., Hoopes S.L., White R.H., Sarisky C.A. (2011) Purine biosynthesis in archaea: variations on a theme. Biol. Direct. 6, 63.
  17. 17. Mikhailopulo I.A., Miroshnikov A.I. (2011) Biologically important nucleosides: modern trends in biotechnology and application. Mendeleev Commun. 21(2), 57.
  18. 18. Mikhailopulo I.A. (2007) Biotechnology of nucleic acid constituents-state of the art and perspectives. Curr. Org. Chem. 11(4), 317–335.
  19. 19. Kulikova I.V., Drenichev M.S., Solyev P.N., Alexeev C.S., Mikhailov S.N. (2019) Effective preparation of 2-deoxyribose 1-phosphate and ribose-1-phosphate, and their use for enzymatic preparation of nucleosides. Eur. J. Org. Chem. 41, 6999–7004.
  20. 20. Komatsu H., Araki T. (2005) Efficient chemo-enzymatic syntheses of pharmaceutically useful unnatural 2′-deoxynucleosides. Nucleosides, Nucleotides Nucl. Acids. 24(5–7), 1127–1130.
  21. 21. Schramm V.L. (2018) Enzymatic transition states and drug design. Chem. Rev. 118(22), 11194‒11258.
  22. 22. Гордон А., Форд Р. (1976) Спутник химика. Москва: Мир.
  23. 23. Tararov V.I., Kolyachkina S.V., Alexeev C.S., Mikhailov S.N. (2011) N6-Acetyl-2′,3′, 5′-tri-O-acetyladenosine; a convenient, ‘missed out’ substrate for regioselective N6-alkylations. Synthesis. 15, 2483–2489.
  24. 24. Alhossary A., Handoko S.D., Mu Y., Kwoh C.-K. (2015) Fast, accurate, and reliable molecular docking with QuickVina 2. Bioinformatics. 31, 2214–2216.
  25. 25. Lewkowicz E.S., Iribarren A.M. (2006) Nucleoside phosphorylases. Curr. Org. Chem. 10(11), 1197‒1215.
  26. 26. Alexeev C.S., Kulikova I.V., Gavryushov S., Tararov V.I., Mikhailov S.N. (2018) Quantitative prediction of yield in transglycosylation reaction catalyzed by nucleoside phosphorylases. Adv. Synth. Catal. 360(16), 3090‒3096.
  27. 27. Oslovsky V.E., Solyev P.N., Polyakov K.M., Alexeev C.S., Mikhailov S.N. (2018) Chemoenzymatic synthesis of cytokinins from nucleosides: ribose as a blocking group. Org. Biomol. Chem. 16(12), 2156–2163.
  28. 28. Kline P.C., Schramm V.L. (1993) Purine nucleoside phosphorylase. Catalytic mechanism and transition-state analysis of the arsenolysis reaction. Biochemistry. 32(48), 13212–13219.
  29. 29. Xie F., Seifert N.A., Heger M., Thomas J., Jäger W., Xu Y. (2019) The rich conformational landscape of perillyl alcohol revealed by broadband rotational spectroscopy and theoretical modelling. Phys. Chem. Chem. Phys. 21, 15408–15416.
  30. 30. Holden C.M., Whittaker D. (1975) Conformational studies of monoterpenes. II–conformational studies of bicyclo[3.1.1]heptane derivatives by 13C NMR. Org. Magn. Reson. 7, 125–127.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека